matplotlib / matplotlib/basemap
Basemap readshapefile should read shapefile for the long/lat specified in the Basemap instance.
Chưa có ai nhận issue này.
- Ngôn ngữ chính
- Python
- Star
- 817
- Fork
- 395
- Chỉ số merge pull request
- Không có pull request nào được merge trong 30 ngày
Mô tả
@wxguy commented a day ago
I need to plot more than 100 images for a specific area which are not included in default Basemap. I have read lot of documentation regarding speeding up the matplotlib/basemap plotting examples. Most of them lead to this example https://github.com/matplotlib/basemap/blob/master/examples/hires.py . I agree that picklling does improve the code for Basemap instance. However, I also required to read the shape file once the Basemap instance is created like following:-
south = 0
north = 5
west = 70
east = 85
following is a global instance and read once only
m = Basemap(projection='merc', llcrnrlat=south, urcrnrlat=north,
llcrnrlon=west, urcrnrlon=east, resolution='c')
the following line a part of plotting function and not a continuous line from above
m.readshapefile('data/gis-data/world_countries/ne_10m_admin_0_countries_lakes', 'ne_10m_admin_0_countries_lakes', linewidth=0.7)
Please see that I am reading shape file from NE 10 resolution file (~ 8 mb). When I read this shape file it takes about 10-15 sec which is too much for just map. This is a big problem as the code (m.readshapefile) reside inside the map plotting function and it has to be called to plot boundaries each time.
I have a question and a proposal (sort of) here.
Question:-
How to improve the plotting time by reducing the reading time of shape file using the default m.readshapefile code. There could be some solution similar to pickle which I am not aware. Best people can share their experience here (with some example code).
Proposal (sort of):-
The major problem with the reading shape file which I think is basemap reading the entire shapefile. Why should it read all the data from shapefile if you the lat/lon which are already specified in the basemap instance. Therefore, readshapefile should only read data within the lon/lat specified from the basemap instance. I hope that this way shapefile read time may be reduced greatly.
I may or may not be correct somewhere above. Forgive my ignorance. I hopr that some one may help me on reading shapefile/ plotting the map faster.
Note ::: Please don't suggest me to use lower resolution basemap/shapefile.
@WeatherGod
Matplotlib Developers member
WeatherGod commented a day ago
I think the difficulty with this request is that Basemap uses the pyshp
package for handling reading of the shapefiles. The last time I checked,
pyshp does not support any sort of constraint-based loading, so all of the
data has to be read in anyway. Now, perhaps it might be possible to find
some optimizations in the overall pipeline, I would have to do some
profiling to find out where the bottlenecks are. It is indeed, too slow and
painful at the moment.
…
@wxguy
wxguy commented 20 hours ago
Thanks for the clarification.
Is it not possible to pickle the shapefile and use it again. At least this would improve the plotting speed. Also is it possible to use contour function so that shapefile is not required to be called many times?
@wxguy
wxguy commented 20 hours ago
It would be great and highly appreciated if this request is accepted.
Moved from https://github.com/matplotlib/matplotlib/issues/5993
Hướng dẫn đóng góp
Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Hướng nghiên cứu
Bắt đầu từ phương thức readshapefile của Basemap và kiểm tra cách nó sử dụng gói pyshp để tải và vẽ dữ liệu shapefile. Lập hồ sơ hiệu năng của pipeline hiện có, sau đó xác định liệu việc vẽ lặp lại có thể tránh đọc lại toàn bộ tệp hoặc giới hạn việc tải trong phạm vi của Basemap hay không; được coi là hoàn thành khi có cải thiện được đo lường mà không cần shapefile có độ phân giải thấp hơn.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Đánh giá
- Công nghệ
- matplotlib, python
- Lĩnh vực
- data-visualization, performance
- Loại issue
- Tính năng
- Độ khó
- 4/5
- Thời gian dự kiến
- 3-5 ngày
- Mức độ hoạt động
- Đình trệ
- Độ rõ ràng
- Khá rõ ràng
- Mức phù hợp với người mới
- 35/100