Error when applying patch that removes submodule

Reproduction steps

on any existing repo that contains a submodule generate a diff that removes it:

$ git rm <submodule name>
$ git diff --staged > remove-submodule.patch

(I used git 2.25.1)
my generated patch looks like this:

diff --git a/.gitmodules b/.gitmodules
index 1b59123..e69de29 100644
--- a/.gitmodules
+++ b/.gitmodules
@@ -1,3 +0,0 @@
-[submodule "submodule"]
-	path = submodule
-	url = ../submodule
diff --git a/submodule b/submodule
deleted file mode 160000
index xxxxx..0000000
--- a/fus-modules
+++ /dev/null
@@ -1 +0,0 @@
-Subproject commit xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx

And when running this small program that uses libgit2:
test.c.txt
built using
gcc test.c -lgit2 -L <path to libgit2>/libgit2/build/ -Wall -pedantic -I <path to libgit2>/libgit2/include/
And run like this:
LD_LIBRARY_PATH=<path to libgit2>/libgit2/build/ ./a.out <Path to repo> <path to patch file>

Expected behavior

It successfully applies the change

Actual behavior

Error applying patch: -1 no error

I checked also modifying the submodule and it fails too

Version of libgit2 (release number or SHA1)

1.3.0 and main ( d74d491481831ddcd23575d376e56d2197e95910 )

Operating system(s) tested

Linux (Ubuntu 20.04)

Bắt đầu với chương trình test.c.txt được đính kèm và tái hiện lỗi bằng một patch xóa hoặc sửa đổi một submodule. Truy vết đường đi áp dụng patch cho kết quả được báo cáo “-1 no error”, sau đó xác minh rằng patch xóa được cung cấp áp dụng thành công trên Linux. Issue không nêu tên tệp nguồn hoặc bài kiểm thử hồi quy, vì vậy việc xác định phần triển khai liên quan và phạm vi bao phủ kiểm thử sẽ cần nghiên cứu repository.