Improve documentation around arrays as values of properties

This issue is opened as a response to https://github.com/kit-data-manager/ro-crate-java/issues/215.

- [ ] document the purpose of add* and set* methods in builders and their difference
- [ ] include array tests like encodingFormat if not already available and test/demonstrate if we can do this with the current API:
```json
{
"@id": "1st-tool.cwl",
"@type": "File",
"name": "First executable tool",
"description": "An example Common Workflow Language File",
"contentSize": "120",
"encodingFormat": ["text/plain", {"@id": "https://www.commonwl.org/v1.0/Workflow.html"}]
}
```
- [ ] There was no code given which generates this, but make sure this error message is only given in appropriate contexts:
```The property:
[ {
"@id" : "xsd:string"
} ]
does not comply with the flattened structure of the RO-Crate json document.
```

Bắt đầu bằng cách kiểm tra các phương thức add* và set* của builder cũng như các bài kiểm thử hiện có cho các thuộc tính có giá trị là mảng. Sử dụng ví dụ encodingFormat để kiểm tra xem API hiện tại có hỗ trợ các mảng hỗn hợp hay không, ghi lại sự khác biệt giữa các phương thức và xác minh khi nào lỗi cấu trúc phẳng là phù hợp.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.