Reshaping Array
@hpages がすでに取り組んでいます。
2019年7月9日 から。
評価
この issue はまだ評価されていません。
説明
First, thanks for the package. It's exactly what we needed. We're working on neuroimaging data: https://github.com/muschellij2/niftiArray. We're trying to do statistics over multiple 3D arrays. I believe this doesn't fit well with DelayedMatrixStats as matrixStats requires 2D matrices.
Similar to https://github.com/Bioconductor/DelayedArray/issues/30 and the comment here https://github.com/Bioconductor/DelayedArray/issues/30#issuecomment-423683637, I was wondering about "reshaping" an array. Really, I want to be able to vectorize a DelayedArray or convert a 4D DelayedArray to a 2D matrix where the first 3 dimensions are the rows of the matrix and the 4th dimension is the columns. I can realize the array, convert to a matrix, and then create a DelayedArray or DelayedMatrix for the current solution.
Ideally, I'd be able to do this without realizing the array into memory. I'm not sure if HDF5 (the backend we're using) would support this, but we would it useful. Trying to set dim or change the dimensions fails due the (correct) checks on DelayedMatrix. Just wondering if it were possible, if it makes sense with HDF5, and if both are true, then would it be possible to implement? I can send a reprex if necessary, but the setting of dimensions is well documented.
- 主要言語
- R
- スター
- 29
- フォーク
- 12
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
コントリビューションガイド
このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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