Can't `cbind` DelayedArray instances with other matrix-likes
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評価
調査の方向性
まず issue にある混在した cbind(y, x) と cbind(y, y) の例を再現し、次に DelayedMatrix に対する bindCOLS のメソッドディスパッチを調べます。cbind が報告されたメソッドエラーなしに DelayedArray と通常の行列を一緒に受け入れ、既存の DelayedArray の結果の動作を維持できれば完了です。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
I could have sworn this used to work.
library(DelayedArray)
x <- matrix(runif(100), 10, 10)
y <- DelayedArray(x)
cbind(y, x)
## Error in (function (classes, fdef, mtable) :
## unable to find an inherited method for function ‘bindCOLS’ for signature ‘"DelayedMatrix"’
Two DelayedArrays are fine:
cbind(y, y)
## <10 x 20> matrix of class DelayedMatrix and type "double":
## etc.
Session information
> sessionInfo()
R version 4.2.0 Patched (2022-05-06 r82323)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 18.04.6 LTS
Matrix products: default
BLAS: /home/luna/Software/R/R-4-2-branch/lib/libRblas.so
LAPACK: /home/luna/Software/R/R-4-2-branch/lib/libRlapack.so
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C
[3] LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8
[5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8
[7] LC_PAPER=en_US.UTF-8 LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] stats4 stats graphics grDevices utils datasets methods
[8] base
other attached packages:
[1] DelayedArray_0.22.0 IRanges_2.30.0 S4Vectors_0.34.0
[4] MatrixGenerics_1.8.0 matrixStats_0.62.0 BiocGenerics_0.42.0
[7] Matrix_1.4-1
loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_4.2.0 grid_4.2.0 lattice_0.20-45
- 主要言語
- R
- スター
- 29
- フォーク
- 12
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
コントリビューションガイド
このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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