Proprietario
NVIDIA-BioNeMo
9 repository indicizzati · Vedi su GitHub
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bionemo-recipes
BioNeMo Recipes: For building and adapting AI models in drug discovery at scale
Python · 857 stelle
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bionemo-agent-toolkit
Turn any agent into a life science expert with NVIDIA BioNeMo skills.
Python · 462 stelle
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Proteina-Complexa
Generative model for protein binder design for protein and small molecule targets. Combines a pretrained flow-based generative model (bui...
Python · 432 stelle
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nvMolKit
A high-performance, GPU-accelerated library for key computational chemistry tasks, such as molecular similarity, conformer generation, an...
Cuda · 276 stelle
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KERMT
KERMT is a pretrained graph neural network model for molecular property prediction.
Python · 99 stelle
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RNAPro
RNAPro is a state-of-the-art RNA 3D folding model developed in collaboration with the hosts and winners of the Stanford RNA 3D Folding Ka...
Python · 98 stelle
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BioNeMo-Inference-Runtime
Easy, fast, and memory-efficient structure prediction inference
Python · 60 stelle
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boltz-cp
Context Parallelism Code for Boltz-2
Python · 59 stelle
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cuik-molmaker
cuik-molmaker is a specialized package designed for molecular featurization, converting chemical structures into formats that can be effe...
C++ · 36 stelle
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100
NVIDIA-BioNeMo/KERMT#31 ·
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Feature request: expose reproducibility metadata and full interface confidence for structure NIMs Aperta
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 42/100
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v1.0 Cleanup Requirements ApertaLow Priority
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
NVIDIA-BioNeMo/nvMolKit#305 ·
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Cleanup
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100
NVIDIA-BioNeMo/nvMolKit#302 ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
NVIDIA-BioNeMo/BioNeMo-Inference-Runtime#5 · 2 commenti ·
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Numpy dtype changes pointer when pickling causing pointer comparison to fail in `compute_atom_dim` Aperta
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100
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All-in-one ETKDG Apertaenhancement
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 38/100
NVIDIA-BioNeMo/nvMolKit#287 ·
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enhancement
NVIDIA-BioNeMo/nvMolKit#286 · 1 assegnatario ·
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nvidia-runners
Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 35/100
NVIDIA-BioNeMo/bionemo-recipes#1726 ·
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enhancement
NVIDIA-BioNeMo/nvMolKit#266 · 1 assegnatario ·
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bug ESM2
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100
NVIDIA-BioNeMo/bionemo-recipes#1698 ·
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Cyclicpeptide design Aperta
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100
NVIDIA-BioNeMo/Proteina-Complexa#56 · 2 commenti ·
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DDP finetuning relies on `find_unused_parameters=True`, masking dead pretrain-head parameters Aperta
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100
NVIDIA-BioNeMo/KERMT#23 ·
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Cannot run on RTX 6000 / Blackwell (sm_120): pinned CUDA 12.6 + JAX 0.4.29 stack is incompatible Aperta
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
NVIDIA-BioNeMo/bionemo-recipes#1681 ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100
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Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 72/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
NVIDIA-BioNeMo/bionemo-agent-toolkit#5 · 2 commenti ·
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bug
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 38/100
NVIDIA-BioNeMo/bionemo-recipes#1669 · 1 commento ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 38/100
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Non-standard amino acid Aperta
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100
NVIDIA-BioNeMo/bionemo-recipes#1647 ·
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Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 72/100
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Difficoltà 1/5 1-3 ore Idoneità per principianti 78/100
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Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 84/100
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Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 76/100
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[Proteina-Complexa] Local finetune crashes: SkipNanGrad incompatible with the fp16 GradScaler Aperta
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 52/100
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 68/100
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[Proteina-Complexa] Fresh UV env installs a torchaudio incompatible with torch → import crash Aperta
Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 88/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 42/100
NVIDIA-BioNeMo/bionemo-recipes#1577 ·
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 52/100
NVIDIA-BioNeMo/Proteina-Complexa#37 · 4 commenti ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100
NVIDIA-BioNeMo/Proteina-Complexa#36 · 1 commento ·
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 65/100
NVIDIA-BioNeMo/RNAPro#4 · 1 commento ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 38/100
NVIDIA-BioNeMo/bionemo-recipes#1561 ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 52/100
NVIDIA-BioNeMo/bionemo-recipes#1560 ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100
NVIDIA-BioNeMo/Proteina-Complexa#32 · 4 commenti ·
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question
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100
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Missing train configs/yamls Aperta
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100
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question
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100
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enhancement
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100
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Residue numbers of motif Apertaenhancement
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100
NVIDIA-BioNeMo/Proteina-Complexa#23 · 1 commento ·
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question
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
NVIDIA-BioNeMo/Proteina-Complexa#9 · 4 commenti ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
NVIDIA-BioNeMo/boltz-cp#1 · 2 commenti ·
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Wet lab data availability Apertaquestion
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
NVIDIA-BioNeMo/Proteina-Complexa#1 · 1 commento ·
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bug
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 32/100
NVIDIA-BioNeMo/bionemo-recipes#1493 · 1 commento ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100
NVIDIA-BioNeMo/KERMT#3 · 4 commenti ·
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make cuik-molmaker optional Aperta
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100
NVIDIA-BioNeMo/KERMT#2 · 2 commenti ·
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100
NVIDIA-BioNeMo/bionemo-recipes#1301 · 3 commenti ·
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bug
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 55/100
NVIDIA-BioNeMo/bionemo-recipes#1272 ·