ann2rr returns ghost beats

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Valutazione

Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Idoneità per principianti
45/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python
Ambito
bioinformatics

Direzione di ricerca

Inizia in hr.py in ann2rr, dove rr_interval viene calcolato con calc_rr(ann.sample, fs=ann.fs). Riproduci il comportamento con annotazioni contenenti etichette come (N e (AFIB, quindi verifica che ulteriori posizioni delle annotazioni non creino più intervalli in eccesso né modifichino il ritmo in quei punti.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Hi,

If the input file, say `atr', contains additional labels, such as (N and (AFIB, ann2rr returns surplus rr intervals at the location of these labels.

Details:
In ann2rr in hr.py the rr intervals are calculated:
rr_interval = calc_rr(ann.sample, fs=ann.fs)

ann.sample contains the beat locations + the annotation location. Hence, ann2rr splits the rr interval which spans over each annotation location into two. This changes the heart rhythm at critical points. For example, at the beginning and end of atrial fibrillation, i.e. at (AFIB and (N.

Lingua principale
Jupyter Notebook
Stelle
853
Fork
322
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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