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HeatmapTrack after applying hg.divide() is not loading

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主要言語
Python
スター
66
フォーク
11
PR マージ指標
30日以内にマージされた PR はありません

説明

Hey everyone,
I'm trying to use the hg.divide function, and it works when I load different datasets with hg.remote(), but not with hg.cooler(). I've tried various approaches, but I haven't been able to get it to work. Could maybe someone help me?

import higlass as hg

t1 = hg.cooler('../dir/file1.mcool')
t2 = hg.cooler('../dir/file2.mcool')

t3 = hg.divide(t1, t2).opts(
    colorRange=["blue", "white"],
    valueScaleMin=0.1,
    valueScaleMax=10,
)

domain = (2e7, 3e7)
v1 = hg.view(t1, width=4).domain(x=domain)
v2 = hg.view(t2, width=4).domain(x=domain)
v3 = hg.view(t3, width=4).domain(x=domain)

view_lock = hg.lock(v1, v2, v3)

(v1 | v3 | v2).locks(view_lock)


Best,
Henrik

コントリビューションガイド

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はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

調査の方向性

まず、2つの hg.cooler 入力と hg.divide を使った、提供されているノートブック形式の例を再現し、その後、動作する hg.remote のケースと比較します。hg.divide と hg.cooler のエントリーポイントを調査します。完了条件は、結果の HeatmapTrack が固定された3ビューのレイアウトで読み込まれ、表示されることです。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

評価

技術スタック
python
領域
data-visualization
issue の種類
バグ
難易度
4/5
見積もり時間
3〜5日
活発さ
停滞
明瞭さ
説明が足りない
初心者へのやさしさ
25/100

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