higlass / higlass/higlass-python
HeatmapTrack after applying hg.divide() is not loading
オープン
まだ誰も着手していません。
- 主要言語
- Python
- スター
- 66
- フォーク
- 11
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
説明
Hey everyone,
I'm trying to use the hg.divide function, and it works when I load different datasets with hg.remote(), but not with hg.cooler(). I've tried various approaches, but I haven't been able to get it to work. Could maybe someone help me?
import higlass as hg
t1 = hg.cooler('../dir/file1.mcool')
t2 = hg.cooler('../dir/file2.mcool')
t3 = hg.divide(t1, t2).opts(
colorRange=["blue", "white"],
valueScaleMin=0.1,
valueScaleMax=10,
)
domain = (2e7, 3e7)
v1 = hg.view(t1, width=4).domain(x=domain)
v2 = hg.view(t2, width=4).domain(x=domain)
v3 = hg.view(t3, width=4).domain(x=domain)
view_lock = hg.lock(v1, v2, v3)
(v1 | v3 | v2).locks(view_lock)
Best,
Henrik
コントリビューションガイド
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
調査の方向性
まず、2つの hg.cooler 入力と hg.divide を使った、提供されているノートブック形式の例を再現し、その後、動作する hg.remote のケースと比較します。hg.divide と hg.cooler のエントリーポイントを調査します。完了条件は、結果の HeatmapTrack が固定された3ビューのレイアウトで読み込まれ、表示されることです。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
評価
- 技術スタック
- python
- 領域
- data-visualization
- issue の種類
- バグ
- 難易度
- 4/5
- 見積もり時間
- 3〜5日
- 活発さ
- 停滞
- 明瞭さ
- 説明が足りない
- 初心者へのやさしさ
- 25/100