Folder project silently becomes a collection after a clone is added

[Filed by Copilot on behalf of @bghgary]

## Problem

In GitHub Copilot app 1.1.14 on Windows, a folder project created at an empty path silently changes from `folder` to `collection` after a Git clone is placed in its root. The value is persisted as `projects.container_kind`; removing the clone or emptying the directory does not restore the project.

## Reproduction

1. Create a folder project at an empty directory and start a folder session successfully.
2. Clone a Git repository into that project root.
3. Remove the clone or empty the root.
4. Start another folder session.

The dispatch fails with `has no associated worktree`, which points to a worktree problem rather than the project's changed classification. After backing up the database, restoring only the stored kind made the same project start folder sessions again without an app restart.

The failed dispatch also leaves a sidebar row that cannot be cleaned up normally: `archive_session` fails with `fatal: not a git repository: (NULL)`, while `delete_item` reports success but leaves the row.

## Expected

Adding a repository under a folder project should not silently change the project type. If conversion is intentional, the app should warn before changing it, identify that change when a folder dispatch is rejected, and allow the failed session row to be removed.

## Related

[github/app#1955](https://github.com/github/app/issues/1955) fixed folder-project creation selecting a nested `.git` directory in v1.1.7. This case happens after a valid folder project has already been created and used.

Tái hiện luồng Windows: tạo một project thư mục trống, clone một repository vào thư mục gốc của nó, làm trống nó và bắt đầu một phiên thư mục khác. Kiểm tra giá trị được lưu của projects.container_kind và folder dispatch bị lỗi, sau đó kiểm tra archive_session và delete_item đối với dòng còn sót lại trong thanh bên. Hoàn tất khi việc thêm một repository không âm thầm thay đổi loại project, các phiên bị từ chối xác định được thay đổi và các dòng bị lỗi có thể được xóa.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.