calc_adc_params can produce off-by-one problems, crashing wrsamp

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Evaluación

Dificultad
3/5
Tiempo estimado
1-2 días
Aptitud para principiantes
45/100
Tipo de issue
Error
Claridad
Bastante claro
Estado de actividad
Estancado
Stack tecnológico
python
Área
data

Línea de trabajo

Comienza con calc_adc_params tal como lo llama wfdb.wrsamp, usando el archivo adjunto data.float32 y el fragmento de reproducción para provocar el fallo. Inspecciona cómo se derivan chmin y chmax para fmt 32 y compáralos con el rango permitido. La tarea estará terminada cuando la reproducción finalice sin un IndexError y los valores sigan dentro de los límites del formato.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

I have some data that crashes wrsamp because calc_adc_params produces values that don't fit the data (off by one):

chmin = -2147483648
chmax = 2147483648
IndexError: Channel 0 contain values outside allowed range [-2147483648, 2147483647] for fmt 32

As you can see, chmax is just above the dmax of 2147483647 for 32.

This is some data for reproduction:
data.float32.zip

You can try it with:

data = np.reshape(np.fromfile("data.float32", dtype=np.float32), [-1, 12])
wfdb.wrsamp(
    record_name="test",
    sig_name=[f"d{x}" for x in range(12)],
    units=["mv"] * 12,
    fs=500,
#    fmt=["16"] * 12,
    p_signal=data
)

Note how passing fmt=16 fixes the problem in this particular case, probably by chance because it happens to not trigger the bug.

Lenguaje dominante
Jupyter Notebook
Estrellas
853
Forks
322
Sin PR fusionados en 30 d

Guía de contribución

No hay ninguna guía de contribución indexada para este repositorio

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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