Inference

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Evaluación

Dificultad
4/5
Tiempo estimado
3-5 días
Aptitud para principiantes
45/100
Tipo de issue
Nueva funcionalidad
Claridad
Necesita aclaración
Estado de actividad
Activo
Stack tecnológico
python
Área
bioinformatics, machine-learning

Línea de trabajo

Comienza localizando el modelo ajustado con fine-tuning en Tahoe y cualquier punto de entrada de inferencia existente; después, inspecciona cómo se representan las matrices de expresión génica de control y las perturbaciones de fármacos. Define un notebook que acepte la matriz de control de un usuario, aplique el modelo y demuestre la predicción de la matriz de expresión de las células perturbadas.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

Thanks for the work!

How can I use your model finetuned on tahoe for instance to predict the gene expression matrix of cells perturbed by a drug given my own gene expression matrix of control cells? That would a very useful notebook to have :).
Raf

Lenguaje dominante
Python
Estrellas
63
Forks
10
Sin PR fusionados en 30 d

Guía de contribución

No hay ninguna guía de contribución indexada para este repositorio

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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