Move chunking utilities from HDF5Array to DelayedArray?
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Evaluación
- Dificultad
- 5/5
- Tiempo estimado
- Más de una semana
- Aptitud para principiantes
- 25/100
Línea de trabajo
Comienza localizando setHDF5DumpChunkLength, setHDF5DumpChunkShape y los helpers relacionados de dimensiones automáticas de chunks en HDF5Array; después, compara qué expone DelayedArray para su reutilización. Revisa las necesidades propuestas de TileDBArray, DelayedRandomArray y SparseArray, tomando issue #89 como contexto; se considera terminado cuando se acuerde un diseño de chunking reutilizable que admita estos backends.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
Here I'm talking about setHDF5DumpChunkLength, setHDF5DumpChunkShape, and whatever extra functions are used to auto-choose "sensible" chunk dimensions for the HDF5 arrays. Can these be moved to DelayedArray for re-use by other backends? I would then be able to use this in TileDBArray and DelayedRandomArray, and I imagine there would also be some kind of re-use for SparseArray. In addition to making backend development easier, it could also improve efficiency by ensuring that interactions between different backends involve the same chunk dimensions. An obvious example is #89, where we could encourage consistency in chunks between the RandomNormMatrix and HDF5Matrix for optimal writing speed.
- Lenguaje dominante
- R
- Estrellas
- 29
- Forks
- 12
- Métricas de merge de PR
- Sin PR fusionados en 30 d
Guía de contribución
No hay ninguna guía de contribución indexada para este repositorio
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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