Changing active project in one window changes it in both

### What Happened?

Attempting to work with different active projects in two windows was not possible since they are synchronized via settings.

### Steps to Reproduce

Open two windows
Change the active project in one window
Observe it changes in the other

### Expected Behavior

It should be possible to work with two different active projects in different windows

### OS Version

8.x (Circe)

### OS Architecture

amd64 (on most hardwares)

### Session Type

Secure Session (Wayland)

### Software Version

Latest release (I have run all updates)

### Log Output

```shell

```

### Hardware Info

_No response_

ファイル、テスト、エントリポイントは指定されていません。2つのウィンドウを開き、一方でアクティブなプロジェクトを変更して問題を再現します。ウィンドウ間の設定の同期を追跡し、各ウィンドウが異なるアクティブなプロジェクトを保持できれば作業完了とみなします。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。