Convert the dataset in hdf5 format to hea format

Offen

#462 erstellt am 17.7.2023 3 Kommentare 0 Reaktionen 0 zugewiesene Personen Auf GitHub ansehen

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Bewertung

Schwierigkeit: 3/5
Geschätzter Aufwand: 1-2 Tage
Anfängerfreundlichkeit: 30/100

Issue-Typ: Bug
Klarheit: Muss geklärt werden
Aktivitätsstatus: Veraltet
Tech-Stack: python
Bereich: data

Rechercherichtung

Beginne damit, den gemeldeten wfdb.wrsamp-Aufruf mit dem 4096×12 float32-ndarray aus code 15% zu reproduzieren und zu untersuchen, wie seine Werte für format 32 validiert werden. Bestimme, ob es sich um ein Problem bei der Eingabekonvertierung oder um einen Bibliotheksfehler handelt; als abgeschlossen gilt die Untersuchung, wenn der Datensatz ohne den gemeldeten IndexError im hea format geschrieben werden kann.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Beschreibung

Hi,
I want to convert the ECG dataset, code 15% into hea format:

wfdb.wrsamp(record_name=filename, fs=fs,
                units=['mV', 'mV', 'mV', 'mV', 'mV', 'mV', 'mV', 'mV', 'mV', 'mV', 'mV', 'mV'],
                sig_name=['I', 'II', 'III', 'aVR', 'aVL', 'aVF', 'V1', 'V2', 'V3', 'V4', 'V5', 'V6'], p_signal=data,
                write_dir=write_dir)

But, the dtype of data ndarray: {4096, 12} in code 15% is float32 and raise IndexError:
IndexError: Channel 1 contain values outside allowed range [-2147483648, 2147483647] for fmt 32.

What should I do for the error?

Vorherrschende Sprache: Jupyter Notebook
Sterne: 853
Forks: 322
PR-Merge-Kennzahlen: Keine gemergten PRs in 30 T.

Beitragsleitfaden

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Erste Schritte

Lesen Sie das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
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