Integrate with GeneTonic

https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-021-04461-5

https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/GeneTonic/inst/doc/GeneTonic_manual.html

Q: I am using a different service/software for generating the results of functional enrichment analysis. How do I plug this into GeneTonic?

A: You can set up a small conversion function, on the line of shake_topGOtableResult and shake_enrichResult (use the source, Luke to see how you can build your own), or request such a function - make sure to specify the formatting specifications of your tool of choice (e.g. DAVID, g:Profiler, or commercial solutions such as Ingenuity Pathway Analysis).

Bắt đầu bằng cách đọc mã nguồn của shake_topGOtableResult và shake_enrichResult, được issue xác định là các ví dụ để xây dựng một hàm chuyển đổi. Làm rõ cần sử dụng enrichment service nào và những đặc tả định dạng nào; được xem là hoàn thành khi đã định nghĩa một hàm chuyển đổi kết nối các kết quả đó vào GeneTonic.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.