D1Database.exec incomplete input error caused by multi-line SQL.

### Which Cloudflare product(s) does this pertain to?

D1

### What versions & operating system are you using?

Wrangler v4.14.1, Node v20.18.3, Linux x86_64 6.6.85-2-MANJARO

### Please provide a link to a minimal reproduction

_No response_

### Describe the Bug

Calls to the `D1Database` `exec` method with a multi-line migration script fail with error:

```sh
✘ [ERROR] Error: D1_EXEC_ERROR: Error in line 1:
CREATE TABLE "users" (: incomplete input: SQLITE_ERROR

at D1DatabaseSessionAlwaysPrimary.exec (cloudflare-internal:d1-api:201:19)
```

To avoid this error, I had to replace all new-lines in my otherwise working migration script with a space:

```ts
await env.siteDbTemp.exec(migration_sql.replaceAll(/\n/gm, " "));
```

The same migration script works in SQLite and it works when sending it to the D1 API via fetch, but it doesn't work locally with a bound `D1Database` instance in my Cloudflare Pages/functions project. I haven't tested it live on Cloudflare.

### Please provide any relevant error logs

_No response_

まず、ローカルにバインドされた D1Database インスタンスで複数行のマイグレーション失敗を再現し、次に同じスクリプトを SQLite で実行した場合および D1 API の fetch パスを通した場合と比較します。D1Database.exec による複数行入力の処理を追跡します。バインドされたインスタンスが改行を置換せずに元のマイグレーションスクリプトを受け付ければ完了です。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。