biocore / biocore/LabControl

Output compression robot name in shotgun prep sheet?

Aperta
#508 1 commento 0 reazioni 0 assegnatari Vedi su GitHub
enhancement priority:low question
Lingua principale
Python
Stelle
2
Fork
15
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Descrizione

The *amplicon* prep sheet includes info on the robots used for various steps of the sample handling. The shotgun process includes a compression step (which the amplicon process does not) for which LabControl records the robot used (see screenshot) ... should this be included in the shotgun prep sheet output?

![shotgun prep sheet could output compression robot](https://user-images.githubusercontent.com/10677935/57476900-70f9a280-724c-11e9-8b79-379bc48295f5.png)

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Direzione di ricerca

Inizia individuando il codice che genera gli output delle schede di preparazione amplicon e shotgun, quindi confronta il modo in cui vengono raccolte le informazioni sui robot per ciascun processo. Controlla come LabControl registra il robot della fase di compressione e determina dove dovrebbe comparire nell’output shotgun. Il lavoro è completato quando la scheda di preparazione shotgun include queste informazioni sul robot senza modificare l’output amplicon.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Valutazione

Stack tecnologico
python
Ambito
backend
Tipo di issue
Funzionalità
Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Stato di attività
Ferma
Chiarezza
Abbastanza chiara
Idoneità per principianti
35/100

Ricevi le nuove issue nella tua casella

Un breve riepilogo di issue GitHub adatte ai principianti.