biocore / biocore/LabControl

Pool amplicon libraries allows for 0 concentration triggering an exception

Offen
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bug priority:high
Vorherrschende Sprache
Python
Sterne
2
Forks
15
PR-Merge-Kennzahlen
Keine gemergten PRs in 30 T.

Beschreibung

It's possible to select the down arrow when specifying a concentration. This results in the following exception:

```bash
AN ERROR HAS OCCURED!
Please copy the following into an issue in our github repository

Error
'<' not supported between instances of 'NoneType' and 'float'

Traceback
Traceback (most recent call last):
File "/Users/dtmcdonald/miniconda3/envs/labcontrol/lib/python3.7/site-packages/tornado/web.py", line 1697, in _execute result = method(*self.path_args, **self.path_kwargs)
File "/Users/dtmcdonald/miniconda3/envs/labcontrol/lib/python3.7/site-packages/tornado/web.py", line 3174, in wrapper return method(self, *args, **kwargs)
File "/Users/dtmcdonald/ResearchWork/software/labman/labcontrol/gui/handlers/process_handlers/pooling_process.py", line 310, in post {"function": "amplicon_pool", "parameters": {}})
File "/Users/dtmcdonald/ResearchWork/software/labman/labcontrol/db/process.py", line 2406, in create if in_comp['input_volume'] < 0.001:
TypeError: '<' not supported between instances of 'NoneType' and 'float'
```

![poolpools_error](https://user-images.githubusercontent.com/474290/56618526-b7f26180-65d7-11e9-9c3d-8cf811afcbca.gif)

Beitragsleitfaden

Für dieses Repository ist kein Beitragsleitfaden indexiert

Rechercherichtung

Beginne mit dem Handler für das Pooling-Formular in labcontrol/gui/handlers/process_handlers/pooling_process.py und verfolge die Anfrage in labcontrol/db/process.py um Zeile 2406, wo input_volume mit 0.001 verglichen wird. Reproduziere die Eingabe über den Abwärtspfeil und untersuche, wie die Konzentration zu None wird. Die Aufgabe ist abgeschlossen, wenn der Pfad für die Konzentration null nicht mehr die gemeldete Ausnahme auslöst.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Bewertung

Tech-Stack
python
Bereich
backend
Issue-Typ
Bug
Schwierigkeit
3/5
Geschätzter Aufwand
1-2 Tage
Aktivitätsstatus
Veraltet
Klarheit
Größtenteils klar
Anfängerfreundlichkeit
42/100

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