Linting stops working or displaying in Atom with pyls > 0.31.2

After upgrading pyls on conda-forge from 0.31.2 -> 0.31.3 or 0.31.4 then ide-python suddenly stops showing any lint comments/warnings/errors. When I downgrade back to 0.31.2 then everything shows up again.

Atom 1.42 (on linux)
ide-python 1.5.0

使用 Atom 1.42、ide-python 1.5.0 和 pyls 0.31.2 重现该问题，然后在 Linux 上将其与 pyls 0.31.3 和 0.31.4 进行比较。阅读现有的 issue 讨论，同时追踪 lint 注释、警告和错误停止显示的原因；完成的标准是使用较新的 pyls 版本时，lint 诊断再次显示。

由索引模型根据 Issue 内容生成。