Problem with detecting "pyls" in the latest debian 10

I had for a long time debian 9 on which I had an atom with ide-python and pyls. Everything worked without problems but after updating to the latest debian 10, ide-python stops detecting pyls. Pyls has been reinstalled by pip and pip3 as directed on the pyls developers site. In the catalog I see bin to pyls and I have a given path to it in ide-python but for some reason ide-python can not cope with its launch.

Debian 10 で Atom の ide-python と設定済みの pyls パスを使って、報告されたセットアップを再現します。まず、インストール後に ide-python が pyls の実行可能ファイルを検出して起動できるか確認します。パッケージが検出され、報告された起動失敗が発生せずに正常に起動すれば完了です。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。