angelolab / angelolab/Nimbus-Inference

Magnification parameter

Ouverte
#61 1 commentaire 0 réactions 0 personnes assignées Voir sur GitHub
enhancement
Langage dominant
Python
Étoiles
45
Forks
9
Métriques de merge des PR
Aucune PR mergée en 30 j

Description

### Description of feature

Hey @JLrumberger ,

I just wanted to ask why the `--magnification` parameter in the `MultiplexDataset` is hardcoded to 20 and is not showing up in the tutorial? Shouldn't that be a highly important parameter to set depending on which microscope/platform the image was acquired on (e.g. CODEX has a much higher resolution thatn IMC etc.). If the dataset has a MPP of 1, does it make sense to set magnification to 10? Did I trace that correctly?

Thanks!

Guide de contribution

Aucun guide de contribution indexé pour ce dépôt

Évaluation

Cette issue n'a pas encore été évaluée.

Recevez les nouvelles issues par e-mail

Un résumé court des issues GitHub adaptées aux débutants.