Dentist parameters

Hi,
I managed to run the pipeline but know I am having a closer look at the options.
My goal is to be conservative with this: I ma happy to fill gaps when there is strong evidence for it but I don't want to mess up the assembly because it is pretty good overall I think.

From what I gathered form the github, --read-coverage combined with the ploidy is one very important option. Do you have any recommendation about how to obtain the coverage value ? Is there recommended tools for this ?

I am thinking I should not play much with the other parameters as I have CLR data.

Any advice on this ?

Best
Aurélien

Issue này yêu cầu hướng dẫn về việc thiết lập các tham số như --read-coverage và ploidy cho việc lấp đầy khoảng trống một cách thận trọng. Trước tiên, hãy đọc README và tài liệu của dự án để hiểu pipeline. Tìm các ví dụ hoặc tệp cấu hình hiện có. Kiểm tra xem có đề cập đến các script hoặc công cụ dùng để tính coverage hay không. Mục tiêu là đưa ra lời khuyên về việc lựa chọn tham số mà không thay đổi assembly.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.