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can't run on large datasets

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Lingua principale
Jupyter Notebook
Stelle
2.5k
Fork
803
Merge medio
6g 22h
PR unite (30g)
3

Descrizione

When I correctly follow the steps in the auto3dseg_hello_world.ipynb notebook, set the corresponding paths and parameters, and run it in an environment with 48G of GPU memory, I encounter the error RuntimeError: Pin memory thread exited unexpectedly while attempting to train on a dataset with 300 .nii.gz images. In contrast, when using a dataset with 20 images, the training proceeds smoothly under the exact same conditions. During the training process with the 300-image dataset, I monitored the GPU memory usage and found it to be less than 70%. However, the error keeps occurring inexplicably. Could there be an issue with the get_data step?

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Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Direzione di ricerca

Inizia eseguendo auto3dseg_hello_world.ipynb con i percorsi e i parametri indicati e confronta i dataset da 20 e 300 immagini in un ambiente con una GPU da 48G. Esamina il passaggio get_data e il punto in cui l’addestramento genera “Pin memory thread exited unexpectedly.”. Il lavoro è completato quando il notebook riesce ad addestrare il modello sul dataset più grande senza questo errore, mantenendo il comportamento del dataset più piccolo.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Valutazione

Stack tecnologico
jupyter-notebook, pytorch
Ambito
machine-learning
Tipo di issue
Bug
Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Stato di attività
Ferma
Chiarezza
Abbastanza chiara
Idoneità per principianti
32/100

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