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can't run on large datasets
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- Lenguaje dominante
- Jupyter Notebook
- Estrellas
- 2.5k
- Forks
- 803
- Merge medio
- 6 d 22 h
- PR fusionados (30 d)
- 3
Descripción
When I correctly follow the steps in the auto3dseg_hello_world.ipynb notebook, set the corresponding paths and parameters, and run it in an environment with 48G of GPU memory, I encounter the error RuntimeError: Pin memory thread exited unexpectedly while attempting to train on a dataset with 300 .nii.gz images. In contrast, when using a dataset with 20 images, the training proceeds smoothly under the exact same conditions. During the training process with the 300-image dataset, I monitored the GPU memory usage and found it to be less than 70%. However, the error keeps occurring inexplicably. Could there be an issue with the get_data step?
Guía de contribución
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
Línea de trabajo
Comience ejecutando auto3dseg_hello_world.ipynb con las rutas y los parámetros indicados, y compare los conjuntos de datos de 20 y 300 imágenes en un entorno con una GPU de 48G. Inspeccione el paso get_data y el punto en el que el entrenamiento genera “Pin memory thread exited unexpectedly.” Se considera terminado cuando el notebook puede entrenar con el conjunto de datos más grande sin este error y se conserva el comportamiento con el conjunto de datos más pequeño.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Evaluación
- Stack tecnológico
- jupyter-notebook, pytorch
- Área
- machine-learning
- Tipo de issue
- Error
- Dificultad
- 4/5
- Tiempo estimado
- 3-5 días
- Estado de actividad
- Estancado
- Claridad
- Bastante claro
- Aptitud para principiantes
- 32/100