Project-MONAI / Project-MONAI/MONAI

ResourceWarning: Implicitly cleaning up

Đang mở
#6,167 2 bình luận 1 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

bug
Ngôn ngữ chính
Python
Star
8.7k
Fork
1.6k
Merge trung bình
5 ngày 1 giờ
Pull request đã merge (30 ngày)
20

Mô tả

Describe the bug
warning message from

python -W error -c "import monai"

with pytorch 2.0

Traceback (most recent call last):
  File "/usr/local/anaconda3/envs/py38/lib/python3.8/weakref.py", line 642, in _exitfunc
    f()
  File "/usr/local/anaconda3/envs/py38/lib/python3.8/weakref.py", line 566, in __call__
    return info.func(*info.args, **(info.kwargs or {}))
  File "/usr/local/anaconda3/envs/py38/lib/python3.8/tempfile.py", line 818, in _cleanup
    _warnings.warn(warn_message, ResourceWarning)
ResourceWarning: Implicitly cleaning up <TemporaryDirectory '/var/folders/6f/fdkl7m0x7sz3nj_t7p3ccgz00000gp/T/tmpqtvvcx_b'>

debugging further looks like it's triggered via importing pytorch ignite

  /usr/local/anaconda3/envs/py38/lib/python3.8/site-packages/ignite/handlers/checkpoint.py(17)<module>()
-> from torch.distributed.optim import ZeroRedundancyOptimizer
  <frozen importlib._bootstrap>(991)_find_and_load()
  <frozen importlib._bootstrap>(975)_find_and_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap>(671)_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap_external>(843)exec_module()
  <frozen importlib._bootstrap>(219)_call_with_frames_removed()
  /usr/local/anaconda3/envs/py38/lib/python3.8/site-packages/torch/distributed/optim/__init__.py(20)<module>()
-> from .named_optimizer import _NamedOptimizer
  <frozen importlib._bootstrap>(991)_find_and_load()
  <frozen importlib._bootstrap>(975)_find_and_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap>(671)_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap_external>(843)exec_module()
  <frozen importlib._bootstrap>(219)_call_with_frames_removed()
  /usr/local/anaconda3/envs/py38/lib/python3.8/site-packages/torch/distributed/optim/named_optimizer.py(10)<module>()
-> from torch.distributed._shard.sharded_tensor import ShardedTensor
  <frozen importlib._bootstrap>(991)_find_and_load()
  <frozen importlib._bootstrap>(961)_find_and_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap>(219)_call_with_frames_removed()
  <frozen importlib._bootstrap>(991)_find_and_load()
  <frozen importlib._bootstrap>(975)_find_and_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap>(671)_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap_external>(843)exec_module()
  <frozen importlib._bootstrap>(219)_call_with_frames_removed()
  /usr/local/anaconda3/envs/py38/lib/python3.8/site-packages/torch/distributed/_shard/__init__.py(1)<module>()
-> from .api import (
  <frozen importlib._bootstrap>(991)_find_and_load()
  <frozen importlib._bootstrap>(975)_find_and_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap>(671)_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap_external>(843)exec_module()
  <frozen importlib._bootstrap>(219)_call_with_frames_removed()
  /usr/local/anaconda3/envs/py38/lib/python3.8/site-packages/torch/distributed/_shard/api.py(6)<module>()
-> from torch.distributed._shard.sharded_tensor import (
  <frozen importlib._bootstrap>(991)_find_and_load()
  <frozen importlib._bootstrap>(975)_find_and_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap>(671)_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap_external>(843)exec_module()
  <frozen importlib._bootstrap>(219)_call_with_frames_removed()
  /usr/local/anaconda3/envs/py38/lib/python3.8/site-packages/torch/distributed/_shard/sharded_tensor/__init__.py(9)<module>()
-> from torch.distributed._shard.partial_tensor import _PartialTensor
  <frozen importlib._bootstrap>(991)_find_and_load()
  <frozen importlib._bootstrap>(975)_find_and_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap>(671)_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap_external>(843)exec_module()
  <frozen importlib._bootstrap>(219)_call_with_frames_removed()
  /usr/local/anaconda3/envs/py38/lib/python3.8/site-packages/torch/distributed/_shard/partial_tensor.py(8)<module>()
-> from torch.distributed.nn.functional import (
  <frozen importlib._bootstrap>(991)_find_and_load()
  <frozen importlib._bootstrap>(961)_find_and_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap>(219)_call_with_frames_removed()
  <frozen importlib._bootstrap>(991)_find_and_load()
  <frozen importlib._bootstrap>(975)_find_and_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap>(671)_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap_external>(843)exec_module()
  <frozen importlib._bootstrap>(219)_call_with_frames_removed()
  /usr/local/anaconda3/envs/py38/lib/python3.8/site-packages/torch/distributed/nn/__init__.py(3)<module>()
-> from .api.remote_module import RemoteModule
  <frozen importlib._bootstrap>(991)_find_and_load()
  <frozen importlib._bootstrap>(975)_find_and_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap>(671)_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap_external>(843)exec_module()
  <frozen importlib._bootstrap>(219)_call_with_frames_removed()
  /usr/local/anaconda3/envs/py38/lib/python3.8/site-packages/torch/distributed/nn/api/remote_module.py(24)<module>()
-> from torch.distributed.nn.jit import instantiator
  <frozen importlib._bootstrap>(1042)_handle_fromlist()
  <frozen importlib._bootstrap>(219)_call_with_frames_removed()
  <frozen importlib._bootstrap>(991)_find_and_load()
  <frozen importlib._bootstrap>(975)_find_and_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap>(671)_load_unlocked()
  <frozen importlib._bootstrap_external>(843)exec_module()
  <frozen importlib._bootstrap>(219)_call_with_frames_removed()
  /usr/local/anaconda3/envs/py38/lib/python3.8/site-packages/torch/distributed/nn/jit/instantiator.py(19)<module>()
-> _TEMP_DIR = tempfile.TemporaryDirectory()
  /usr/local/anaconda3/envs/py38/lib/python3.8/tempfile.py(781)__init__()
-> self._finalizer = _weakref.finalize(
> /usr/local/anaconda3/envs/py38/lib/python3.8/weakref.py(519)__init__()
-> if len(args) >= 3:

(fyi @vfdev-5 )

Hướng dẫn đóng góp

Mở hướng dẫn đóng góp

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Hướng nghiên cứu

Tái hiện cảnh báo bằng python -W error -c "import monai" và kiểm tra chuỗi import qua PyTorch Ignite đến torch.distributed.nn.jit.instantiator.py, nơi thư mục tạm thời được tạo. Xác định liệu MONAI có thể tránh kích hoạt cảnh báo dọn dẹp hay không; được xem là hoàn tất khi việc import không còn tạo ra ResourceWarning đã nêu.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Đánh giá

Công nghệ
python, pytorch
Lĩnh vực
machine-learning
Loại issue
Lỗi
Độ khó
4/5
Thời gian dự kiến
3-5 ngày
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Độ rõ ràng
Cần làm rõ
Mức phù hợp với người mới
25/100

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.