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calc_adc_params can produce off-by-one problems, crashing wrsamp

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Lingua principale
Jupyter Notebook
Stelle
853
Fork
322
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Descrizione

I have some data that crashes wrsamp because calc_adc_params produces values that don't fit the data (off by one):

chmin = -2147483648
chmax = 2147483648
IndexError: Channel 0 contain values outside allowed range [-2147483648, 2147483647] for fmt 32

As you can see, chmax is just above the dmax of 2147483647 for 32.

This is some data for reproduction:
data.float32.zip

You can try it with:

data = np.reshape(np.fromfile("data.float32", dtype=np.float32), [-1, 12])
wfdb.wrsamp(
    record_name="test",
    sig_name=[f"d{x}" for x in range(12)],
    units=["mv"] * 12,
    fs=500,
#    fmt=["16"] * 12,
    p_signal=data
)

Note how passing fmt=16 fixes the problem in this particular case, probably by chance because it happens to not trigger the bug.

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Direzione di ricerca

Inizia con calc_adc_params così come viene chiamato da wfdb.wrsamp, usando il file allegato data.float32 e lo snippet di riproduzione per attivare il malfunzionamento. Esamina come vengono derivati chmin e chmax per fmt 32 e confrontali con l'intervallo consentito. Il lavoro è completato quando la riproduzione termina senza un IndexError, mentre i valori rimangono entro i limiti del formato.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Valutazione

Stack tecnologico
python
Ambito
data
Tipo di issue
Bug
Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Stato di attività
Ferma
Chiarezza
Abbastanza chiara
Idoneità per principianti
45/100

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