DiODeProject/MuMoT

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Multiscale Modelling Tool - mathematical modelling without the maths

Sterne: 24
Forks: 5
Offene Anfänger-Issues: 0
Indexierte Issues: 59

Vorherrschende Sprache: Python
Lizenz: GPL-3.0
Letzter GitHub-Push: 18.3.2022
Zuletzt indexiert: 15.9.2026
Beitragsleitfaden: Kein Beitragsleitfaden
Verhaltenskodex: Kein Verhaltenskodex
Anfänger-Labels: help wanted good first issue
PR-Merge-Kennzahlen: Keine gemergten PRs in 30 T.

Offen Alle

Bisher 59 offene Issues indexiert

Add dynamic plotting while computation is running (especially useful for multiagent simulations) Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#7 · 3 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Add color selection by user for state Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#11 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Add bounded arena Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#15 · 3 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Figure download is not working on Chrome Offen

wontfix

DiODeProject/MuMoT#21 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
View logs lag plots in interactive mode Offen

bug

DiODeProject/MuMoT#26 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
An error in Jupyter cell stops the plotting of previous figures Offen

wontfix

DiODeProject/MuMoT#55 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Vector and stream could have first parameters as optional (and set through widgets) Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#95 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Improve quality of visualise images and LaTeX rendering Offen

DiODeProject/MuMoT#130 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Refactor code moving members into base classes where possible Offen

DiODeProject/MuMoT#132 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
The dropdown widget of MuMoTstochasticSimulationController for the Final distribution visualisation does not render latex correctly Offen

wontfix

DiODeProject/MuMoT#136 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Allow multicontrollers to encapsulate multiple models Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#141 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Allow for creating models from Python strings Offen

enhancement good first issue

DiODeProject/MuMoT#156 · 6 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
LaTeX in output cells slow to render Offen

bug

DiODeProject/MuMoT#162 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Add plot of noise spectrum from noise solutions Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#165 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Use nbval to perform regression testing on MuMoTtest.ipynb Offen

enhancement testing

DiODeProject/MuMoT#187 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Readthedocs should open external sites in new browser windows Offen

documentation enhancement

DiODeProject/MuMoT#198 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Use parser library in parseModel Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#199 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Add figures based on parameter sweeps of numerical simulations Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#212 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Stream lines shading should be scaled to avoid barely visible stream lines Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#218 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Allow substitute() to perform simple reactants scaling and time scaling Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#222 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Feature request: create and save animated gif of multiagent or SSA runtime plots Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#224 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Feature request: support for 2-simplex (ternary) plot Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#225 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Expand options for types of graphs in multiagent() network topology Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#226 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
SSA multiple runs plots: change box plots for shaded confidence intervals Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#227 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Bifurcation() fails to find all branches Offen

help wanted question

DiODeProject/MuMoT#228 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Implement model cell bookmarking Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#244 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Implement more sophisticated analytic and numerical noise solutions / approximations Offen

enhancement help wanted

DiODeProject/MuMoT#251 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
remove MuMoTcontroller._plotLimitsWidget and use the self._widgetsExtraParams['plotLimits'] Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#281 · 4 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
showNoise in MuMoTfieldControllers should be treated as all other parameters and a widget created accordingly Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#282 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
MuMoTfieldController should include the toggle 'plotProportions' as most other controllers do Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#283 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
aggregateResults toggle in MuMoTfieldController should only trigger replotting without re-computing all data Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#284 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Check advanced multicontroller bookmarks Offen

bug

DiODeProject/MuMoT#292 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Enable result download for non-stochastic simulation views Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#305 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Implement custom download results widget Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#308 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Consider DOI release assignment strategy Offen

documentation question

DiODeProject/MuMoT#319 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Consider pointing binder icon to latest release branch Offen

documentation enhancement question

DiODeProject/MuMoT#320 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Greek letters should be used consistently in all functions Offen

DiODeProject/MuMoT#324 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Test suite: run all notebooks in one or more dirs rather than explicitly named notebooks Offen

enhancement testing

DiODeProject/MuMoT#325 · 9 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Enhance random walk computation Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#326 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Update contributors Offen

documentation

DiODeProject/MuMoT#327 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Add type hints Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#328 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
1d stream plot does not appear in full after re-generation using sliders Offen

bug help wanted

DiODeProject/MuMoT#329 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Replace global var figcounter with matplotlib.pyplot.get_fignums()? Offen

DiODeProject/MuMoT#333 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Document 1d and 3d stream plots Offen

documentation

DiODeProject/MuMoT#335 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Visualise noise in 3d stream plot Offen

enhancement

DiODeProject/MuMoT#336 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 2 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Add unit tests Offen

testing

DiODeProject/MuMoT#339 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Clean exceptions Offen

DiODeProject/MuMoT#352 · 3 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Multicontrollers missing some advanced options Offen

bug

DiODeProject/MuMoT#353 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Muticontroller plot warning Offen

warning

DiODeProject/MuMoT#355 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Reduce runtime of CI jobs? Offen

enhancement question

DiODeProject/MuMoT#366 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026

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