"The EntityManager is closed" with Symfony and Doctrine2 modules

#### What are you trying to achieve?

Use the Symfony and Doctrine2 modules together, to allow "cleanup" by reversing transactions between tests, in functional tests against an SQLite database.

#### What do you get instead?

Many tests are simply failing with

```bash
[Doctrine\ORM\ORMException] The EntityManager is closed.
```
If I do not enable the Doctrine2 module, the tests all succeed. But without it enabled, the transactions are not implemented and reversed between tests.

functional.suite.yml is as follows

```yml
class_name: FunctionalTester
modules:
enabled:
- \Helper\Functional
- Asserts
- Cli
- Filesystem
- REST
- Symfony:
environment: test
var_path: 'var'
- Doctrine2:
depends: Symfony
cleanup: true
```
### Details

* Codeception version: 2.4.5
* PHP Version: 7.2
* Operating System: Linux Mint
* Installation type: Composer

Bắt đầu bằng cách tái hiện lỗi với functional.suite.yml, Symfony trong môi trường kiểm thử và Doctrine2 với cleanup được bật trên SQLite. Truy dấu tương tác giữa việc dọn dẹp transaction và EntityManager đã đóng; công việc được xem là hoàn tất khi các bài kiểm thử chức năng chạy thành công với các transaction được hoàn tác giữa các bài kiểm thử và không có exception.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.