CodeForPhilly / CodeForPhilly/chime

Allow user to specify R0 (in lieu of doubling time)

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enhancement hospital-request python wontfix
Langage dominant
Python
Étoiles
210
Forks
153
Métriques de merge des PR
Aucune PR mergée en 30 j

Description

Calculation (extends "more info about this tool"):

We can compute the implicit $R_0$ from our doubling time inputs and our assumed duration of infectiousness $(1/\gamma)$. Since $R_0$ is the number of additional individuals infected by each infected individual when $I << S$, we can compute the growth rate $g$ as a function of $R_0$ and $\gamma$:
$$g = \gamma R_0 $$
From our previous equation for $g$, we can substitute and rearrange to find:
$$R_0 = (2^{1/T_d} - 1)/\gamma$$

So, for our $\gamma$ of 1/14 days, a doubling time of 4 days corresponds to an $R_0$ of 2.65.

Guide de contribution

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Piste de recherche

Commencez par localiser l’entrée et le calcul existants du temps de doublement décrits dans l’issue. Déterminez à quel endroit une entrée R0 remplacerait ou compléterait cette entrée, puis vérifiez que le modèle produit la relation indiquée pour gamma de 1/14 jours et un temps de doublement de quatre jours. Le travail est terminé lorsque le choix d’entrée pris en charge et le calcul qui en résulte sont clairs et validés.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Évaluation

Stack technique
python
Domaine
backend
Type d'issue
Fonctionnalité
Difficulté
5/5
Temps estimé
Plus d'une semaine
Activité
À l'abandon
Clarté
À clarifier
Accessibilité débutants
25/100

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