BlueBrain / BlueBrain/BluePyMM

Isolate BluePyMM from BluePyOpt using API provided by user

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enhancement
Lingua principale
Python
Stelle
13
Fork
9
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Descrizione

To allow for easier testing of the e-models provided, and to simplify the bluepymm main code, we should remove the bluepyopt specific code from the bluepymm core, and let the user implement an API to interact with the model.
Example of api functions (names are crazy of course):
create_hoc_for_parameters
run_model_and_return_score_for_certain_morphology

We probably should add a submodule to bluepymm to provide an example of such an API that can be adapted for user specific needs if necessary.

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Direzione di ricerca

Non vengono indicati file o test; inizia tracciando il codice specifico di BluePyOpt nel codice principale di BluePyMM e identifica le interazioni con i modelli che richiedono un confine API. Definisci l’API fornita dall’utente e il sottmodulo di esempio proposto, quindi verifica che il core non dipenda più da BluePyOpt e che l’esempio supporti un testing più semplice dei modelli.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Valutazione

Stack tecnologico
python
Ambito
backend
Tipo di issue
Refactoring
Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Stato di attività
Ferma
Chiarezza
Da chiarire
Idoneità per principianti
25/100

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