BlueBrain / BlueBrain/BluePyMM
Isolate BluePyMM from BluePyOpt using API provided by user
- Vorherrschende Sprache
- Python
- Sterne
- 13
- Forks
- 9
- PR-Merge-Kennzahlen
- Keine gemergten PRs in 30 T.
Beschreibung
To allow for easier testing of the e-models provided, and to simplify the bluepymm main code, we should remove the bluepyopt specific code from the bluepymm core, and let the user implement an API to interact with the model.
Example of api functions (names are crazy of course):
create_hoc_for_parameters
run_model_and_return_score_for_certain_morphology
We probably should add a submodule to bluepymm to provide an example of such an API that can be adapted for user specific needs if necessary.
Beitragsleitfaden
Für dieses Repository ist kein Beitragsleitfaden indexiert
Rechercherichtung
Es sind keine Dateien oder Tests benannt; beginne damit, den BluePyOpt-spezifischen Code im Hauptcode von BluePyMM nachzuverfolgen und die Modellinteraktionen zu identifizieren, die eine API-Grenze benötigen. Definiere die vom Benutzer bereitgestellte API und das vorgeschlagene Beispielsubmodul, und überprüfe anschließend, dass der Kern nicht mehr von BluePyOpt abhängt und das Beispiel einfacheres Testen von Modellen unterstützt.
Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.
Bewertung
- Tech-Stack
- python
- Bereich
- backend
- Issue-Typ
- Refactoring
- Schwierigkeit
- 5/5
- Geschätzter Aufwand
- Über eine Woche
- Aktivitätsstatus
- Veraltet
- Klarheit
- Muss geklärt werden
- Anfängerfreundlichkeit
- 25/100