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py38 functional tests run forever

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主要言語
Python
スター
13
フォーク
9
PR マージ指標
30日以内にマージされた PR はありません

説明

The run step freezes after bluepymm.select_combos: test select_combos based on example simple1 test is executed.

Here is the last log produced, nothing else gets written after this log.

   bluepymm.select_combos: test select_combos based on example simple1 ... /home/runner/work/BluePyMM/BluePyMM/bluepymm/select_combos/reporting.py:379: FutureWarning: The frame.append method is deprecated and will be removed from pandas in a future version. Use pandas.concat instead.
    ext_neurondb = ext_neurondb.append(emodel_ext_neurondb_rows)
  /home/runner/work/BluePyMM/BluePyMM/bluepymm/select_combos/reporting.py:381: FutureWarning: The frame.append method is deprecated and will be removed from pandas in a future version. Use pandas.concat instead.
    megate_passed_all = megate_passed_all.append(
  /home/runner/work/BluePyMM/BluePyMM/bluepymm/select_combos/reporting.py:383: FutureWarning: The frame.append method is deprecated and will be removed from pandas in a future version. Use pandas.concat instead.
    median_scores = median_scores.append(emodel_median_scores)
  /home/runner/work/BluePyMM/BluePyMM/bluepymm/select_combos/reporting.py:384: FutureWarning: The frame.append method is deprecated and will be removed from pandas in a future version. Use pandas.concat instead.
    passed_combos = passed_combos.append(emodel_passed_combos)
  /home/runner/work/BluePyMM/BluePyMM/bluepymm/select_combos/reporting.py:379: FutureWarning: The frame.append method is deprecated and will be removed from pandas in a future version. Use pandas.concat instead.
    ext_neurondb = ext_neurondb.append(emodel_ext_neurondb_rows)
  /home/runner/work/BluePyMM/BluePyMM/bluepymm/select_combos/reporting.py:381: FutureWarning: The frame.append method is deprecated and will be removed from pandas in a future version. Use pandas.concat instead.
    megate_passed_all = megate_passed_all.append(
  /home/runner/work/BluePyMM/BluePyMM/bluepymm/select_combos/reporting.py:383: FutureWarning: The frame.append method is deprecated and will be removed from pandas in a future version. Use pandas.concat instead.
    median_scores = median_scores.append(emodel_median_scores)
  /home/runner/work/BluePyMM/BluePyMM/bluepymm/select_combos/reporting.py:384: FutureWarning: The frame.append method is deprecated and will be removed from pandas in a future version. Use pandas.concat instead.
    passed_combos = passed_combos.append(emodel_passed_combos)
  /home/runner/work/BluePyMM/BluePyMM/bluepymm/select_combos/reporting.py:313: UserWarning: Tight layout not applied. The bottom and top margins cannot be made large enough to accommodate all axes decorations.
    plt.tight_layout()
  ok

コントリビューションガイド

このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません

はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

調査の方向性

simple1 の例に基づく select_combos の機能テストから始め、次に bluepymm/select_combos/reporting.py の 313 行目と 379-384 行目付近を調べます。実行を再現し、最後のログ出力の後に何が起こるかを確認します。テストがフリーズせずに完了すれば完了です。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

評価

技術スタック
pandas, python
領域
testing-qa
issue の種類
バグ
難易度
3/5
見積もり時間
1〜2日
活発さ
停滞
明瞭さ
おおむね明確
初心者へのやさしさ
45/100

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