BlueBrain / BlueBrain/BluePyMM
memory issue in select with large number of combos
- Lenguaje dominante
- Python
- Estrellas
- 13
- Forks
- 9
- Métricas de merge de PR
- Sin PR fusionados en 30 d
Descripción
It fails here: https://github.com/BlueBrain/BluePyMM/blob/master/bluepymm/select_combos/table_processing.py#L284
because the large dataframe is copied several times in the arg_list. There may be something simple to do here to fix that issue (or allow users to bypass multiprocessing).
Guía de contribución
No hay ninguna guía de contribución indexada para este repositorio
Línea de trabajo
Comienza en bluepymm/select_combos/table_processing.py#L284 y sigue cómo el gran dataframe se copia en arg_list durante el multiprocesamiento. Reproduce el fallo con un gran número de combinaciones y mide el uso de memoria. Se considera terminado cuando se evitan las copias repetidas o se proporciona una forma documentada de omitir el multiprocesamiento, preservando el comportamiento de selección original.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Evaluación
- Stack tecnológico
- python
- Área
- data
- Tipo de issue
- Error
- Dificultad
- 4/5
- Tiempo estimado
- 3-5 días
- Estado de actividad
- Estancado
- Claridad
- Bastante claro
- Aptitud para principiantes
- 35/100