BlueBrain / BlueBrain/BluePyMM

Add voltage collages to BluePyMM

Offen
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Vorherrschende Sprache
Python
Sterne
13
Forks
9
PR-Merge-Kennzahlen
Keine gemergten PRs in 30 T.

Beschreibung

We should add a step that generates voltage collages of the traces generated by a sample of the cells.

E.g. for neocortex it would be useful to reinject the threshold / holding current in the cells and plot the output.

This way a human can check if everything is working correctly. (and if e.g. eFEL is not creating any weird artifacts)

Beitragsleitfaden

Für dieses Repository ist kein Beitragsleitfaden indexiert

Rechercherichtung

Es ist keine Datei oder kein Test benannt. Beginne damit, den BluePyMM-Workflow nachzuverfolgen, der Spannungsspuren von Beispielzellen erzeugt, und ermittle dann, wo das erneute Einspeisen von Schwellen- und Halteströmen hinzugefügt werden kann und wie Collagen erzeugt werden sollten. Erledigt ist die Aufgabe, wenn repräsentative Neokortex-Ausgaben visuell auf Fehler und eFEL-Artefakte überprüft werden können.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Bewertung

Tech-Stack
python
Bereich
backend, data-visualization
Issue-Typ
Feature
Schwierigkeit
4/5
Geschätzter Aufwand
3-5 Tage
Aktivitätsstatus
Veraltet
Klarheit
Größtenteils klar
Anfängerfreundlichkeit
35/100

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