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BergelsonLab

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blabr

R · 1 estrella
add_samples
Adds 5 new 2-min code sections to existing eaf files

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generate_all_bl

R · 0 estrellas
blabpy
Python package to facilitate lab work

Python · 0 estrellas

Abierto Todos

please do merge into aclew Abierto

BergelsonLab/add_samples#2 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Add a README Abierto

help wanted

BergelsonLab/generate_all_bl#1 · 1 comentario · 0 reacciones · 3 asignados · Indexado el 14/9/2026
allow user to ignore missing Seedlings files Abierto

BergelsonLab/blabpy#1 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
write logs to the output directory, not the current one Abierto

BergelsonLab/blabpy#2 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
zero-duration should be dealt with in the cha files, not in the code Abierto

BergelsonLab/blabpy#3 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
unomment timestamp consistency checks Abierto

BergelsonLab/blabpy#4 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
parallelize all seedlings-level pipeline operations Abierto

BergelsonLab/blabpy#6 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
substitute logging for all prints Abierto

BergelsonLab/blabpy#7 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
do not merge with basic level data on NA annotid Abierto

bug

BergelsonLab/blabpy#8 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
remove listened_time._process_regions - not used anywhere Abierto

listen time

BergelsonLab/blabpy#10 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
clean listened_time functions once we are done Abierto

listen time

BergelsonLab/blabpy#11 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
clean up the logic of removing subregions with makeup/extra overlapping Abierto

listen time

BergelsonLab/blabpy#12 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
deal with non-empty folder errors when running make_updated_basic_level_files Abierto

enhancement

BergelsonLab/blabpy#13 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
refactor tests Abierto

BergelsonLab/blabpy#14 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
add io functions for various csv files Abierto

BergelsonLab/blabpy#15 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
use explicit NA for the pho column Abierto

BergelsonLab/blabpy#16 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
path lookup should (?) all check that the path exists Abierto

BergelsonLab/blabpy#17 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
vihi.paths: checking ids should be a decorator Abierto

refactor

BergelsonLab/blabpy#18 · 1 comentario · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
upload blabpy to a conda channel Abierto

BergelsonLab/blabpy#19 · 1 comentario · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
add function to easily concatenate dataframe Abierto

BergelsonLab/blabpy#20 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
drop annotation count from blabpy.listen_time.preprocess_region_info Abierto

BergelsonLab/blabpy#21 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
clean up "pipeline" modules Abierto

BergelsonLab/blabpy#22 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
add missing fields to setup.py Abierto

BergelsonLab/blabpy#23 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
add days_to_months function Abierto

BergelsonLab/blabpy#24 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
remove caching from seedlings.paths Abierto

bug

BergelsonLab/blabpy#25 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
write a `map_plus` function Abierto

BergelsonLab/blabpy#26 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
pandas helper: where join Abierto

BergelsonLab/blabpy#27 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
avoid printing traceback for console script errors Abierto

BergelsonLab/blabpy#29 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
make git cloning progress bar prettier Abierto

good first issue

BergelsonLab/blabpy#31 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
add `vihi annotation update-links` Abierto

BergelsonLab/blabpy#32 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
CHA files function not working Abierto

BergelsonLab/blabpy#34 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
its.py new sub_recording column names Abierto

bug

BergelsonLab/blabpy#35 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
big_aggregate missing documentation Abierto

BergelsonLab/blabr#7 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
a function for by-kid, by-item cdi info Abierto

BergelsonLab/blabr#9 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
get_windows needs to have an argument to set TargetOnset Abierto

BergelsonLab/blabr#10 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
add Description to DESCRIPTION Abierto

long overdue

BergelsonLab/blabr#13 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
add missing documentation (lots!) Abierto

BergelsonLab/blabr#14 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
fix inconistent docs Abierto

might already be done

BergelsonLab/blabr#15 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
add examples to functions Abierto

might already be done

BergelsonLab/blabr#16 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
[possibly] switch to using roxygen for maintaining NAMESPACE Abierto

might already be done

BergelsonLab/blabr#17 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
add `expect_column_hashes_to_be_equal` to `test-helpers.R` Abierto

might already be done refactor

BergelsonLab/blabr#20 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
add `io.R` to have all read/write functions in one place Abierto

refactor

BergelsonLab/blabr#21 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
sample_intervals_with_highest should stop if there are NAs Abierto

BergelsonLab/blabr#22 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
fix assertthat assertions Abierto

bug might already be done

BergelsonLab/blabr#23 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
rewrite calculate_lena_like_stats using add_lena_stats Abierto

might already be done

BergelsonLab/blabr#24 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
teach prepare_intervals to output aclew-like intervals Abierto

enhancement

BergelsonLab/blabr#25 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
clean up get_lena_speaker_stats Abierto

enhancement

BergelsonLab/blabr#26 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
export public-facing functions Abierto

BergelsonLab/blabr#27 · 2 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
get_pn_opus_path does not return anything Abierto

BergelsonLab/blabr#28 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
update DESCRIPTION Abierto

BergelsonLab/blabr#29 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026

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