AllenNeuralDynamics / AllenNeuralDynamics/comb

missing some event traces

Đang mở
#17 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub
Ngôn ngữ chính
Python
Star
1
Fork
0
Chỉ số merge pull request
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Mô tả

**Describe the bug**
Events table returns lower number of ROIs compared to dff valid ROIs and cell_specimen_table.valid.sum()

**To Reproduce**

> session_name = 'multiplane-ophys_721291_2024-05-16_08-57-00'
> bod = BehaviorOphysDataset(...)
>
> cstable = bod.cell_specimen_table
> print(set(cstable[cstable.valid_roi].index.values) - set(bod.events.index.values))
> print(list(set(bod.events.index.values) - set(cstable[cstable.valid_roi].index.values)))
> print(bod.events.shape)
> print(bod.dff_traces[~bod.dff_traces.noise.isna()].shape)

**Expected behavior**
events table having the same shape of no_nan dff_traces table and number of valid ROIs

Hướng dẫn đóng góp

Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này

Đánh giá

Issue này chưa được đánh giá.

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.