AllenNeuralDynamics / AllenNeuralDynamics/comb

missing some event traces

オープン
#17 コメント 0 件 リアクション 0 件 担当者 0 名 GitHub で見る
主要言語
Python
スター
1
フォーク
0
PR マージ指標
30日以内にマージされた PR はありません

説明

**Describe the bug**
Events table returns lower number of ROIs compared to dff valid ROIs and cell_specimen_table.valid.sum()

**To Reproduce**

> session_name = 'multiplane-ophys_721291_2024-05-16_08-57-00'
> bod = BehaviorOphysDataset(...)
>
> cstable = bod.cell_specimen_table
> print(set(cstable[cstable.valid_roi].index.values) - set(bod.events.index.values))
> print(list(set(bod.events.index.values) - set(cstable[cstable.valid_roi].index.values)))
> print(bod.events.shape)
> print(bod.dff_traces[~bod.dff_traces.noise.isna()].shape)

**Expected behavior**
events table having the same shape of no_nan dff_traces table and number of valid ROIs

コントリビューションガイド

このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません

評価

この issue はまだ評価されていません。

新しい issue をメールで受け取る

初心者向けの GitHub issue を短くまとめたダイジェスト。