AllenNeuralDynamics / AllenNeuralDynamics/clabe

Requirements for configuration tracking

Đang mở
#100 3 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub
Ngôn ngữ chính
Python
Star
0
Fork
0
Merge trung bình
3 giờ 27 phút
Pull request đã merge (30 ngày)
3

Mô tả

A module to track animal-related configuration would be useful to agilize experiments. A short term solution would be to extend the current default picker with a more opinionated logic on how to fetch and validate a full session of a given animal. Alternatively, this could ideally be handled by a centralized data base structure.

Requirements: (Mostly derived from VrForaging but in theory applicable to other pipelines)
- We need to be able to store JSON documents (bonus for other asset types?)
- From a rig_id (`aibs_rig_id` and a task (`task_name`), grab rig configuration (or potentially multiple if available)
- List multiple task configuration files (these would be used as defaults if needed)
- From an animal id, return a task_configuration (`task_logic.json` or a `CurriculumState`, both of which are sufficient to grab a `task_name`).
- From an animal id, return a experimental schedule: e.g. Experimenter, `aibs_rig_id`, TimeOfDay, etc...
- From a given rig configuration instance, grab a rig.json (aind-data-schema)
- Need an API to read and write to the collection. Ideally Python, but bonus if also C#.
- Ideally would store all the documents ever written/updates

Hướng dẫn đóng góp

Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này

Đánh giá

Issue này chưa được đánh giá.

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.