AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach

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Issue indicizzate: 64

Lingua principale: Python
Licenza: MIT
Ultimo push su GitHub: 24/4/2026
Ultima indicizzazione: 13/9/2026
Guida per i contributori: Nessuna guida per i contributori
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Invalid/corrupt metadata files Aperta

Metadata

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#17 · 3 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Thalmanac comprehensive pipeline Aperta

Analysis

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#34 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Video for generating metadata w/ pydantic Aperta

documentation

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#36 · 5 commenti · 0 reazioni · 3 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
Compile list of intermediate/advanced tutorial topics Aperta

documentation

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#43 · 2 commenti · 0 reazioni · 4 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
Specimen procedures have an extra field for "subject_id" with a different subject_id than the asset Aperta

Metadata

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#51 · 7 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Follow up on model metadata new schema usage Aperta

Metadata

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#53 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
MERFISH vs Carter lab data integration Aperta

Analysis

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#58 · 2 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Write Data Platform paper Aperta

paper

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#69 · 1 commento · 0 reazioni · 2 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
Write Metadata schema paper Aperta

paper

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#70 · 2 commenti · 0 reazioni · 2 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
2D/3D densities from Smartspim cells Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#73 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
CO R user experience support Aperta

Analysis

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#77 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Get data out of private buckets Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#78 · 4 commenti · 0 reazioni · 3 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
Write SWDB Databook tutorial on using Xarray Aperta

documentation SWDB Workshop

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#79 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Support other atlases in thalmanac Aperta

Analysis

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#87 · 2 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Basic example of morphology feature calculation using analysis architecture Aperta

Analysis

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#109 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
NWB for slice physiology Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#116 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Create benchmark for aind-metadata-viz llm Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#122 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
NP Ultra Interneurons data reorganization Aperta

SWDB

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#128 · 2 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Add How to cite to morphology portal Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#129 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Publish Data Infrastructure page to AIND Website Aperta

Website

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#182 · 0 commenti · 0 reazioni · 2 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
Publish population ophys platform page Aperta

Website

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#183 · 1 commento · 0 reazioni · 2 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
Publish Virtual Reality Protocol Aperta

Protocols

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#201 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Publish Registering MRI Volumes to Ephys Rig Protocol Aperta

Protocols

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#211 · 0 commenti · 0 reazioni · 2 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
Publish Mouse Habituation Protocol Aperta

Protocols

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#209 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
tool to add s3 mount capability for external use of public CO capsules Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#194 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
share tools for settings sync in codeocean Aperta

internal support

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#195 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
adapt processing.json generation for post-capsule usage Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#199 · 3 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
analysis framework example for workshops etc Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#214 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Support for Ulises metadata - derived asset from DANDI data Aperta

internal support Metadata

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#215 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Upgrade NP Ultra rig Aperta

Metadata

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#216 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
gh action to add tags for CO releases Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#239 · 3 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
clean up quicknii registration code Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#248 · 3 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
explore hosting webalign/warp tools with s3 access Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#249 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
CO syncing github action Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#251 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
support all types in auto-app-panel Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#259 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
find minimal example for bug with pushing to CO git repo Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#261 · 2 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
explore brainrender/vedo/pyvista for CAT session Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#263 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
"Project" level views that are neither project_name or subject_id alone Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#264 · 2 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
script/app to check capsule data status before release Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#265 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
update exaspim LC asset metadata Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#272 · 7 commenti · 0 reazioni · 2 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
create CO run scheduler roadmap proposal Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#279 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
pin down work items for thalamus tools manuscript Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#282 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
explore CAJAL embeddings for RT morphology analysis Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#283 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
public collection highlighting commonly used reference data like CCF / ABC atlas Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#285 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
support code release for Thalamus tools manuscript (Marcus) Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#286 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
support exaspim QC Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#290 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
analysis framework pipeline for smartspim injection volume quantification Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#291 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Confocal imaging ingest Aperta

Metadata

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#292 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Publish Thick-Tissue Multi-Round RNA-FISH on Expanded Mouse Brain Slices Following in vivo 2-photon Imaging Protocol Aperta

Protocols

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#295 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Respiration data challenge Aperta

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#297 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026

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