AllenNeuralDynamics/Rhapso

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An open-source Python toolkit for large-scale fluorescence microscopy data alignment and fusion.

Stelle: 9
Fork: 3
Issue aperte per principianti: 0
Issue indicizzate: 17

Lingua principale: Python
Licenza: MIT
Ultimo push su GitHub: 29/7/2026
Ultima indicizzazione: 13/9/2026
Guida per i contributori: Nessuna guida per i contributori
Codice di condotta: Nessun codice di condotta
Label per principianti: Nessuna label per principianti indicizzata
Metriche di merge delle PR: Nessuna PR unita negli ultimi 30g

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17 issue aperte indicizzate

Feature Detection dsxy and dsz downsampling implementation missing for levels outside the existing multiscales Aperta

AllenNeuralDynamics/Rhapso#151 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
Integration Tests: Attach working XML files for all XML formats and workflows that are supported by Rhapso Aperta

AllenNeuralDynamics/Rhapso#163 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
Refactor multiscale ray integration to the pipeline level so it is agnostic to the distributed environment Aperta

AllenNeuralDynamics/Rhapso#182 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Implement Multichannel stitching Aperta

AllenNeuralDynamics/Rhapso#186 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Optimize Split Fusion implementation Aperta

AllenNeuralDynamics/Rhapso#209 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Implement Phase Correlation based registration Aperta

AllenNeuralDynamics/Rhapso#232 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
Handle intensity adjustments in multiscale for downsampled scales Aperta

AllenNeuralDynamics/Rhapso#233 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Resolve Zarr v3 + fsspec/s3fs async aiohttp sessions unclosed after S3 reads/writes. Aperta

AllenNeuralDynamics/Rhapso#250 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
Add matchviz like metrics Aperta

AllenNeuralDynamics/Rhapso#253 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Test failures in main Aperta

AllenNeuralDynamics/Rhapso#264 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
Run Tests workflow is disabled Aperta

AllenNeuralDynamics/Rhapso#265 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
Upgrade to python 3.12 for Tiff support Aperta

AllenNeuralDynamics/Rhapso#275 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
Update multiscale zarr metadata ordering Aperta

AllenNeuralDynamics/Rhapso#280 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Add round 2 round registration Aperta

AllenNeuralDynamics/Rhapso#285 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
Add compression params for fusion and multiscale Aperta

AllenNeuralDynamics/Rhapso#289 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Add intensity-based candidate matching and RANSAC over full point set for R2R Aperta

AllenNeuralDynamics/Rhapso#292 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Add r2r visualization metrics for TPS displacement field solving Aperta

AllenNeuralDynamics/Rhapso#293 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026

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