AllenNeuralDynamics/Rhapso

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An open-source Python toolkit for large-scale fluorescence microscopy data alignment and fusion.

Sterne: 9
Forks: 3
Offene Anfänger-Issues: 0
Indexierte Issues: 17

Vorherrschende Sprache: Python
Lizenz: MIT
Letzter GitHub-Push: 29.7.2026
Zuletzt indexiert: 13.9.2026
Beitragsleitfaden: Kein Beitragsleitfaden
Verhaltenskodex: Kein Verhaltenskodex
Anfänger-Labels: Keine Anfänger-Labels indexiert
PR-Merge-Kennzahlen: Keine gemergten PRs in 30 T.

Offen Alle

Bisher 17 Issues indexiert

Feature Detection dsxy and dsz downsampling implementation missing for levels outside the existing multiscales Offen

AllenNeuralDynamics/Rhapso#151 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Integration Tests: Attach working XML files for all XML formats and workflows that are supported by Rhapso Offen

AllenNeuralDynamics/Rhapso#163 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Refactor multiscale ray integration to the pipeline level so it is agnostic to the distributed environment Offen

AllenNeuralDynamics/Rhapso#182 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Implement Multichannel stitching Offen

AllenNeuralDynamics/Rhapso#186 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Optimize Split Fusion implementation Offen

AllenNeuralDynamics/Rhapso#209 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Implement Phase Correlation based registration Offen

AllenNeuralDynamics/Rhapso#232 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Handle intensity adjustments in multiscale for downsampled scales Offen

AllenNeuralDynamics/Rhapso#233 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Resolve Zarr v3 + fsspec/s3fs async aiohttp sessions unclosed after S3 reads/writes. Offen

AllenNeuralDynamics/Rhapso#250 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Add matchviz like metrics Offen

AllenNeuralDynamics/Rhapso#253 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Test failures in main Offen

AllenNeuralDynamics/Rhapso#264 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Run Tests workflow is disabled Offen

AllenNeuralDynamics/Rhapso#265 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Upgrade to python 3.12 for Tiff support Offen

AllenNeuralDynamics/Rhapso#275 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Update multiscale zarr metadata ordering Offen

AllenNeuralDynamics/Rhapso#280 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Add round 2 round registration Offen

AllenNeuralDynamics/Rhapso#285 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Add compression params for fusion and multiscale Offen

AllenNeuralDynamics/Rhapso#289 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Add intensity-based candidate matching and RANSAC over full point set for R2R Offen

AllenNeuralDynamics/Rhapso#292 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Add r2r visualization metrics for TPS displacement field solving Offen

AllenNeuralDynamics/Rhapso#293 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026

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