AllenNeuralDynamics/Rhapso

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An open-source Python toolkit for large-scale fluorescence microscopy data alignment and fusion.

Estrellas: 9
Forks: 3
Issues abiertos para principiantes: 0
Issues indexados: 17

Lenguaje dominante: Python
Licencia: MIT
Último push a GitHub: 29/7/2026
Última indexación: 13/9/2026
Guía de contribución: Sin guía de contribución
Código de conducta: Sin código de conducta
Etiquetas para principiantes: Sin etiquetas para principiantes indexadas
Métricas de merge de PR: Sin PR fusionados en 30 d

Abierto Todos

17 issues abiertos indexados

Feature Detection dsxy and dsz downsampling implementation missing for levels outside the existing multiscales Abierto

AllenNeuralDynamics/Rhapso#151 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Integration Tests: Attach working XML files for all XML formats and workflows that are supported by Rhapso Abierto

AllenNeuralDynamics/Rhapso#163 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Refactor multiscale ray integration to the pipeline level so it is agnostic to the distributed environment Abierto

AllenNeuralDynamics/Rhapso#182 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Implement Multichannel stitching Abierto

AllenNeuralDynamics/Rhapso#186 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Optimize Split Fusion implementation Abierto

AllenNeuralDynamics/Rhapso#209 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Implement Phase Correlation based registration Abierto

AllenNeuralDynamics/Rhapso#232 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Handle intensity adjustments in multiscale for downsampled scales Abierto

AllenNeuralDynamics/Rhapso#233 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Resolve Zarr v3 + fsspec/s3fs async aiohttp sessions unclosed after S3 reads/writes. Abierto

AllenNeuralDynamics/Rhapso#250 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Add matchviz like metrics Abierto

AllenNeuralDynamics/Rhapso#253 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Test failures in main Abierto

AllenNeuralDynamics/Rhapso#264 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Run Tests workflow is disabled Abierto

AllenNeuralDynamics/Rhapso#265 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Upgrade to python 3.12 for Tiff support Abierto

AllenNeuralDynamics/Rhapso#275 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Update multiscale zarr metadata ordering Abierto

AllenNeuralDynamics/Rhapso#280 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Add round 2 round registration Abierto

AllenNeuralDynamics/Rhapso#285 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Add compression params for fusion and multiscale Abierto

AllenNeuralDynamics/Rhapso#289 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Add intensity-based candidate matching and RANSAC over full point set for R2R Abierto

AllenNeuralDynamics/Rhapso#292 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Add r2r visualization metrics for TPS displacement field solving Abierto

AllenNeuralDynamics/Rhapso#293 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026

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