AllenCell / AllenCell/cyto-dl

Data loading error in 2 channel input to 1 channel output labelfree

Đang mở
#374 15 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub
Ngôn ngữ chính
Python
Star
32
Fork
11
Chỉ số merge pull request
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Mô tả

Hi @benjijamorris , I'm still figuring out how to do a multi channel input to a single channel output. To me it seems that my configuration settings are correct but I might be wrong. Can you help me point out if I'm missing out any configuration changes. I have my input image in the source column which is a 2 channel image. And target column has a 1 channel image.

`spatial_dims=3, raw_im_channels=2`

for source column:
```
dimension_order_out: CZYX
channel_dim: -1
```

for target column:
`dimension_order_out: YX`

I'm getting the following error currently which looks like I'm not loading the dimensions in correct order.
`ValueError: Crop size [32 32] is too large for image size [ 1 96]`

Input image's info: it's a 2 channel 96x96 image
image

Hướng dẫn đóng góp

Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này

Đánh giá

Issue này chưa được đánh giá.

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.