AllenCell / AllenCell/benchmarking_representations

Rewrite confusing model training instructions

Offen
#87 0 Kommentare 0 Reaktionen 1 zugewiesene Person Beansprucht von @ritvikvasan Auf GitHub ansehen
Vorherrschende Sprache
Python
Sterne
7
Forks
5
PR-Merge-Kennzahlen
Keine gemergten PRs in 30 T.

Beschreibung

These instructions in USAGE.md confused me
> Create a single cell manifest (e.g. csv, parquet) for each dataset with a column corresponding to final processed paths, and create a split column corresponding to train/test/validation split.
Update the final single cell dataset path (SINGLE_CELL_DATASET_PATH) and the column in the manifest for appropriate input modality (SDF_COLUMN/SEG_COLUMN/POINTCLOUD_COLUMN/IMAGE_COLUMN) in each [datamodule file](https://github.com/AllenCell/benchmarking_representations/blob/main/configs/data). e.g. for PCNA data these yaml files are located here -

We should rewrite. (Discussed specifics in person)

Beitragsleitfaden

Für dieses Repository ist kein Beitragsleitfaden indexiert

Bewertung

Dieses Issue wurde noch nicht bewertet.

Neue Issues direkt in Ihr Postfach

Eine kurze Übersicht über anfängerfreundliche GitHub-Issues.