AllenCell / AllenCell/allencell-segmenter-ml

Patch size grid artifact in segmentation mask output

Đang mở
#541 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub
needs prioritization Requests
Ngôn ngữ chính
Python
Star
5
Fork
3
Chỉ số merge pull request
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Mô tả

Megaseg model patch size edges not being blended so grid artifacts present in output masks.

**How important is this feature to you? (Software team will re-prioritize all tickets based on current workload)**
high priority bug since it introduces artifacts in structure segmentation mask.

**Describe the solution you'd like**
Easiest thing would be to make a checkbox to set the patch size to the whole fov xyz dims so these artifacts go away. Could also work on optimizing the fusing/blending of edge overlap areas so that output segmentation masks don't have these artifacts.

**Additional context**
Add any other context or screenshots about the feature request here.
![image](https://github.com/user-attachments/assets/e40e83df-92c8-4cfd-a6e7-0bb206f77d20)

Hướng dẫn đóng góp

Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này

Đánh giá

Issue này chưa được đánh giá.

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.