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AaronRipleyQiagen

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NMDX-Data-Analysis

Jupyter Notebook · 2 Sterne

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Bisher 17 offene Issues indexiert

Obtain Complete Dataset to be used for Analysis Offen

AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis#1 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Write Script to plot amplification curves for the "groups" identified in analysis. Offen

enhancement

AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis#6 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Write Script to Create Sample Key for 4Plex ROC Analysis Offen

enhancement

AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis#10 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Upload 4Plex V2 Compiled Data to neumodxRawDataDB Offen

datarequest

AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis#11 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 2 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Adapt ROC Analysis Script used for EBV to work for 4Plex V2 Offen

enhancement

AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis#12 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Write First Draft of Protocol for 4Plex V2 Cutoff Verification Offen

documentation

AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis#13 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Write Draft of Report for 4Plex V2 Cutoff Verification Offen

documentation

AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis#14 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Write Draft of Technical Report for findings of Investigation Offen

documentation

AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis#15 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Organize Main Branch Offen

AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis#20 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Write Function to determine if Neighboring lanes of PCR Cartridges had a specific Localized Result. Offen

enhancement

AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis#25 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Write Function to determine if time in extraction plate or cartridge between LHPA, LHPB and LHPC impact localized result's Ct, MPH, EP, and EPR. Offen

enhancement

AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis#28 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Common code dictionary Offen

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AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis#30 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Write a function that takes a Gen2 data file to create summary tables Offen

enhancement

AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis#31 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Write a scrip to generate consumable list and line data from Gen2 data file Offen

enhancement

AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis#33 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Ct Ep MPH summary from gen2 CSV file Offen

enhancement

AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis#34 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Include overall result calls and flags information in the Gen2 datafile Offen

datarequest

AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis#35 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Generation barcode list for new V&V study Offen

good first issue

AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis#37 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026

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