Include overall result calls and flags information in the Gen2 datafile

I have searched through a few gen2 datafiles, I think they are currently missing the positive/negative column.

Need to come up a smart way to handle the super long STR in the flags

既存のGen2 datafile構造を調査し、欠落しているpositive/negative列を把握します。長いSTRフラグをどのように扱うかを判断します。これらのファイルを読み書きするデータ処理スクリプトをリポジトリ内で探し、現在のスキーマと変更が必要な箇所を確認します。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。