v2: Handle multi-model problems

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#392 创建于 2025年6月5日 2 条评论 0 个 reaction 已指派 0 人在 GitHub 查看

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评估

难度: 5/5
预计耗时: 一周以上
新手友好度: 25/100

Issue 类型: 功能
描述清晰度: 需要澄清
活跃度: 停滞
技术栈: python
领域: backend

调研方向

Start by reviewing the PEtab v2 semantics in the linked pull request #622 and the completed prerequisite #391. Then investigate how Problem currently represents models, whether a CompositeProblem is needed, and the validation rules affected. Done means supporting multiple models, updating the validations, and adding petab.v2.C.MODEL_ID.

由索引模型根据 Issue 内容生成。

描述

PEtab v2 clarifies the semantics for using multiple models inside a single PEtab problem, see https://github.com/PEtab-dev/PEtab/pull/622/files. We need to adapt to that.

This requires:

#391
Multiple models inside Problem, or adding a CompositeProblem on top of Problem
Updating many validation rules
petab.v2.C.MODEL_ID
...

主要语言: Python
星标: 18
派生: 9
PR 合并指标: 30 天内没有已合并 PR

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