Merge cinnabar-absolute and cinnabar RBFE plotting docs
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评估
- 难度
- 3/5
- 预计耗时
- 1-2 天
- 新手友好度
- 68/100
- Issue 类型
- 文档
- 描述清晰度
- 基本清楚
- 活跃度
- 冷清
- 技术栈
- jupyter-notebook
- 领域
- cli, documentation
调研方向
比较 cinnabar_absolute.ipynb 和 plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb，首先阅读两个 notebook 的流程，以及它们如何使用 openfe CLI 的输出。将它们合并为一个通用的 Cinnabar 绘图 notebook，其中包含独立的 RBFE 和 ABFE 部分，然后验证两种结果类型都已涵盖，并确认该 notebook 适合用于 openfe 文档。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/cookbook/cinnabar_absolute.ipynb is currently not used in the openfe docs, we should merge it into https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb to make a general plotting with cinnabar notebook with sections for RBFE and ABFE result plotting starting from outputs from the openfe CLI.
- 主要语言
- Jupyter Notebook
- 星标
- 70
- 派生
- 15
- 平均合并
- 10 小时 42 分钟
- 30 天内合并 PR
- 2
贡献指南
这个仓库没有索引到贡献指南
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
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