Changig column classes is slow.
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 4/5
- Thời gian dự kiến
- 3-5 ngày
- Mức phù hợp với người mới
- 35/100
- Loại issue
- Lỗi
- Độ rõ ràng
- Khá rõ ràng
- Mức độ hoạt động
- Đình trệ
- Công nghệ
- r
- Lĩnh vực
- performance
Hướng nghiên cứu
Start by benchmarking the reported mydata[, names(mydata) := lapply(.SD, as.character)] operation against fread(..., colClasses=list(character=1:3775)) on similarly large mixed-type data. Trace the column-class conversion path and measure whether an alternative or improvement avoids the reported slowdown; done means faster conversion with results equivalent to the current method.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
I'm working with large datasets (around 4GB), mixing dates, numbers and factors.
And I want to perform operations such as changing all column classes to character.
mydata[, names(mydata) := lapply(.SD, as.character)]
But it's quite slow.
If you just had the data on the disk and reload it with
my <- fread("mydata.csv", stringsAsFactors=F, colClasses=list(character=1:3775))
it's much faster.
Is there alternative to the first method?
Or maybe it could be improved in some way.
- Ngôn ngữ chính
- R
- Star
- 3.9k
- Fork
- 1.1k
- Merge trung bình
- 14 giờ 4 phút
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 4
Hướng dẫn đóng góp
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của Rdatatable/data.table
-
as.data.table() recurses without end on a survival::Surv object (or any data.frame carrying one) Đang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 88/100
Rdatatable/data.table#7887 ·
-
consistency tests
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
Rdatatable/data.table#7853 · 3 bình luận ·
-
internals
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 65/100
Rdatatable/data.table#6938 · 1 bình luận ·
-
encoding fread
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 65/100
Rdatatable/data.table#5179 · 8 bình luận ·
-
documentation programming
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
Rdatatable/data.table#3199 · 3 bình luận ·
Tất cả issue của Rdatatable/data.table
Issue tương tự
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 82/100
r-lib/pkgdepends#485 · 3 bình luận ·
-
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 92/100
-
beginners blocker
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
-
enviPathR Đang mởBuild Error Build OK Build Warning policies-accepted pre-review precheck-passed
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 84/100
Bioconductor/BiocContributions#207 · 6 bình luận ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 74/100
datacarpentry/semester-biology#1255 ·